脚本宝典收集整理的这篇文章主要介绍了本周最新文献速递20211010,脚本宝典觉得挺不错的,现在分享给大家,也给大家做个参考。
本周最新文献速递20211010
文献题目: Single-cell epigenomics reveals mechanisms of human cortical development
不想看英文题目: 单细胞表观组学揭示人类皮层发育机制
杂志和影响因子: Nature (IF: 42.778; Q1)
研究意义: 在人类大脑发育过程中,细胞命运规范和地形特征对于细胞身份的鉴定尤为重要。单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 已发现了大脑皮层的多个细胞类型,然而,较少研究描述大脑发育过程中染色质状态的变化以及不同神经元谱系的发育机制。
结论:
亮点: 通过分析人类大脑发育过程中单个细胞的染色质状态,发现了数千个神经元分化的瞬时可及性峰,且部分峰反映了神经发育过程中控制细胞命运的机制,此外该研究还发现 RA 信号有助于人类 PFC 兴奋性神经元的分化;
文章链接:
https://www.nature.COM/articles/s41586-021-03209-8
公开的资料:
scATAC-seq and scRNA-seq: https://assets.nemoArchive.org/dat-gnot1gb https://www.synapse.org/#!Synapse:syn21392931 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE163018
PEak level scATAC-seq Primary and organoid ATAC-seq data: https://cortex-atac.cells.ucsc.edu/ https://urldefense.PRoofpoint.com/v2/url?u=https-3A__genome.ucsc.edu_s_Max_cortex-2Datac&d=DwIBaQ&c=iORugZls2LlyyCAZRB3XLg&r=wIGwA13tJ0H_yBH_8fGR_aHDv_Lb9BdBvaGRmKuMfC8&m=C-AKivMuKdU2JxBfFMIkS53e2NDAh9SJrG2tdmW5_MU&s=Sg2BoS6TTUoAMLyXiaM6hGHhNtG9LqaubpXoPQxWBuQ&e=
Code: https://github.com/NOW-Lab/scATACcortex
文献题目: Polygenic basis and biomedical consequences of telomere length VARiation
不想看英文题目: 端粒长度变异的多基因效应和相应的生物医学表型结局
杂志和影响因子: Nat Genet (IF: 27.603; Q1)
研究意义: 端粒是染色体的末端片段,在细胞增殖和衰老中起着关键作用。作者研究了白细胞端粒长度 (LTL) 相关变异的遗传结构,并在 472,174 名英国生物银行 (UKB) 参与者中分析了 LTL 与生物医学表型之间的因果关系。
结论:
亮点: 提供了 LTL 与许多复杂疾病和特征相关的资源;
文章链接:
https://www.nature.com/articles/s41588-021-00944-6
公开的资料:
Summary statistics:https://figshare.com/s/caa99dc0f76d62990195
下面的文献也挺精彩的,但由于下不到原文,或博主时间有限,没法精细解读,故列出来供各位参阅; 当然,你们有精彩的文献想让我解读的(前提是一周内刚出炉的文献),可给我发pDF(然而可能种种原因,我不一定有时间解读,不要对我抱太高期待);
文献题目: A transcriptomic and epigenomic cell atlas of the mouse primary motor cortex
不想看英文题目: 小鼠初级运动皮层的转录组学和表观组学细胞图谱
杂志和影响因子: Nature (IF: 42.778; Q1)
文章链接:
https://www.nature.com/articles/s41586-021-03500-8
文献题目: DNA methylation atlas of the mouse brain at single-cell resolution
不想看英文题目: 单细胞分辨率下小鼠大脑的 DNA 甲基化图谱
杂志和影响因子: Nature (IF: 42.778; Q1)
文章链接:
https://www.nature.com/articles/s41586-020-03182-8
文献题目: An atlas of gene regulatory elements in adult mouse cerebrum
不想看英文题目: 成年小鼠大脑基因调控元件图谱
杂志和影响因子: Nature (IF: 42.778; Q1)
文章链接:
https://www.nature.com/articles/s41586-021-03604-1
文献题目: A high-resolution HLA reference panel capturing global population diversity enables multi-ancestry fine-mapping in HIV host response
不想看英文题目: 构建全球五大人群(n = 21,546) 的 HLA 参考面板实现多血统精细定位
杂志和影响因子: Nat Genet (IF: 27.603; Q1)
文章链接:
https://www.nature.com/articles/s41588-021-00935-7
文献题目: Pig genome functional annotation enhances the bioLOGical interpretation of complex traits and human disease
不想看英文题目: 猪基因组功能注释增强了人类疾病和复杂性状的生物学解释
杂志和影响因子: Nat Commun (IF: 14.92; Q1)
文章链接:
https://www.nature.com/articles/s41467-021-26153-7
文献题目: scMRA: A robust deep learning method to annotate scRNA-seq data with multiple reference datasets
不想看英文题目: scMRA:基于深度学习方法整合多个参考数据集注释 scRNA-seq 数据
杂志和影响因子: Bioinformatics (IF: 5.61; Q1)
文章链接:
https://doi.org/10.1093/bioinformatics/BTab700
致谢橙子牛奶糖(陈文燕),请用参考模版:We thank the blogger (orange_milk_sugar, Wenyan Chen) for XXX
感谢小可爱们多年来的陪伴, 我与你们一起成长~
以上是脚本宝典为你收集整理的本周最新文献速递20211010全部内容,希望文章能够帮你解决本周最新文献速递20211010所遇到的问题。
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